Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTRT1Q8TDG2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTRT1Q8TDG2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms