Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MDM1Q8TC05 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms