Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RP9Q8TA86 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms