Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ5

TNIP2, TNFAIP3-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2Q8NFZ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNIP2Q8NFZ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNIP2Q8NFZ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNIP2Q8NFZ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms