Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFBP1Q8NEF9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFBP1Q8NEF9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFBP1Q8NEF9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms