Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIK3C3Q8NEB9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIK3C3Q8NEB9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms