Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HJURPQ8NCD3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HJURPQ8NCD3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HJURPQ8NCD3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms