Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCB2

CAMKV, CaM kinase-like vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKVQ8NCB2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAMKVQ8NCB2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAMKVQ8NCB2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAMKVQ8NCB2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms