Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPC24Q8NBT2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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