Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NHLRC2Q8NBF2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NHLRC2Q8NBF2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms