Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TC2NQ8N9U0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TC2NQ8N9U0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TC2NQ8N9U0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms