Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AMER3Q8N944 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMER3Q8N944 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AMER3Q8N944 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AMER3Q8N944 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms