Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C3

TRIML2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML2, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML2Q8N7C3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIML2Q8N7C3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIML2Q8N7C3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIML2Q8N7C3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms