Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC17Q8N6Y2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms