Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN19Q8N6F1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN19Q8N6F1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN19Q8N6F1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN19Q8N6F1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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