Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM20Q8N5G0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM20Q8N5G0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM20Q8N5G0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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