Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHCHD4Q8N4Q1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD4Q8N4Q1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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