Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA2

CCDC144CP, Putative coiled-coil domain-containing protein 144C, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144CPQ8IYA2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC144CPQ8IYA2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC144CPQ8IYA2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144CPQ8IYA2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144CPQ8IYA2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144CPQ8IYA2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144CPQ8IYA2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144CPQ8IYA2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144CPQ8IYA2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144CPQ8IYA2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144CPQ8IYA2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144CPQ8IYA2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144CPQ8IYA2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms