Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIBP1Q86W92 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIBP1Q86W92 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIBP1Q86W92 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms