Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD163Q86VB7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CD163Q86VB7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD163Q86VB7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD163Q86VB7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD163Q86VB7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD163Q86VB7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD163Q86VB7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CD163Q86VB7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD163Q86VB7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD163Q86VB7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD163Q86VB7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD163Q86VB7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD163Q86VB7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD163Q86VB7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD163Q86VB7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CD163Q86VB7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD163Q86VB7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CD163Q86VB7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD163Q86VB7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD163Q86VB7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD163Q86VB7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD163Q86VB7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD163Q86VB7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD163Q86VB7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD163Q86VB7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD163Q86VB7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD163Q86VB7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD163Q86VB7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD163Q86VB7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD163Q86VB7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD163Q86VB7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD163Q86VB7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD163Q86VB7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD163Q86VB7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD163Q86VB7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD163Q86VB7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD163Q86VB7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD163Q86VB7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD163Q86VB7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD163Q86VB7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD163Q86VB7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD163Q86VB7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD163Q86VB7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD163Q86VB7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD163Q86VB7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CD163Q86VB7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD163Q86VB7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD163Q86VB7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD163Q86VB7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD163Q86VB7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD163Q86VB7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD163Q86VB7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD163Q86VB7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD163Q86VB7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms