Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms