Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD4Q76G19 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD4Q76G19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms