Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAPN12Q6ZSI9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms