Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF493Q6ZR52 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF493Q6ZR52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF493Q6ZR52 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF493Q6ZR52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF493Q6ZR52 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF493Q6ZR52 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF493Q6ZR52 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF493Q6ZR52 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF493Q6ZR52 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF493Q6ZR52 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF493Q6ZR52 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms