Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCARA5Q6ZMJ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCARA5Q6ZMJ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms