Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LBX2Q6XYB7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LBX2Q6XYB7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LBX2Q6XYB7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms