Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PACS1Q6VY07 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PACS1Q6VY07 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms