Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C16orf54Q6UWD8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C16orf54Q6UWD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C16orf54Q6UWD8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms