Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SAMD1Q6SPF0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SAMD1Q6SPF0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms