Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C19orf48Q6RUI8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C19orf48Q6RUI8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms