Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TXNDC11Q6PKC3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TXNDC11Q6PKC3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TXNDC11Q6PKC3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms