Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTR9Q6PD62 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTR9Q6PD62 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTR9Q6PD62 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTR9Q6PD62 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms