Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC41PQ6P2S7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC41PQ6P2S7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC41PQ6P2S7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC41PQ6P2S7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms