Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP3Q6NUK4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
REEP3Q6NUK4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REEP3Q6NUK4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms