Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRAMD4Q6IC98 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRAMD4Q6IC98 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRAMD4Q6IC98 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms