Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPH4

XAF1, XIAP-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAF1Q6GPH4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.29■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
XAF1Q6GPH4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XAF1Q6GPH4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XAF1Q6GPH4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XAF1Q6GPH4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XAF1Q6GPH4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XAF1Q6GPH4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XAF1Q6GPH4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms