Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO4Q6EEV6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO4Q6EEV6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms