Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TIGD3Q6B0B8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TIGD3Q6B0B8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms