Protein–RNA interactions for Protein: Q5W5X9

TTC23, Tetratricopeptide repeat protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23Q5W5X9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC23Q5W5X9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC23Q5W5X9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC23Q5W5X9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC23Q5W5X9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC23Q5W5X9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms