Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM236Q5W0B7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM236Q5W0B7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM236Q5W0B7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms