Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM208BQ5VWN6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM208BQ5VWN6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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