Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP2LQ5T4T6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP2LQ5T4T6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196 ms