Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T1

TMEM170B, Transmembrane protein 170B, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM170BQ5T4T1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM170BQ5T4T1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM170BQ5T4T1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms