Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAP1Q5SW96 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAP1Q5SW96 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAP1Q5SW96 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms