Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC1Q4ZHG4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC1Q4ZHG4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms