Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GREB1Q4ZG55 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GREB1Q4ZG55 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GREB1Q4ZG55 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms