Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC36A3Q495N2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC36A3Q495N2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms