Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL9Q3SXZ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTLL9Q3SXZ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTLL9Q3SXZ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms