Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIT3Q3SXY7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRIT3Q3SXY7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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