Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL38Q2WGJ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL38Q2WGJ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL38Q2WGJ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms